Seorang siswa pindahan aneh bernama Ougi Oshino baru saja tiba di Sekolah Menengah Swasta Naoetsu. Dia dengan cepat diperkenalkan kepada siswa senior Koyomi Araragi oleh teman bersama mereka Kanbaru Suruga, dengan harapan mendapatkan nasehat tentang penemuan aneh yang dia buat. Setelah melihat tata letak sekolah, Ougi melihat bahwa sebuah kelas telah muncul di area yang kosong — tempat yang seharusnya tidak ada.

Tidak yakin apakah ini karya penampakan, Araragi dan Ougi berusaha mengungkap kebenaran di balik teka-teki ini. Tapi Araragi segera menemukan, setelah menemukan dirinya terkunci dengan Ougi, bahwa ruangan itu menyimpan kenangan akan peristiwa yang telah lama ia lupakan.