Dalam novel visual, bendera imajiner didefinisikan sebagai peristiwa yang berfungsi sebagai titik balik untuk keseluruhan cerita. Seorang pemain yang memicu bendera romansa untuk seorang pahlawan wanita akan melanjutkan ke rutenya, atau bendera kematian akan menandakan bahwa karakter tertentu akan mati setelahnya.

Siswa SMA Souta Hatate dapat melihat bendera ini di atas kepala seseorang, dan memiliki kemampuan untuk menurunkannya untuk menghentikan peristiwa tertentu terjadi. Menggunakan kekuatan ini, dia telah mencegah kematian orang lain. Tapi, setelah kecelakaan masa lalu dengan dia sebagai satu-satunya yang selamat, dia akhirnya percaya bahwa hanya kemalangan yang akan menimpa orang-orang di dekatnya, dan telah menahan diri untuk berteman atau menjalin hubungan sejak saat itu.

Namun, semuanya mulai berubah setelah pindah ke sekolah baru. Setelah menjatuhkan bendera kematian lainnya, teman sekelasnya Nanami Knight Bladefield memperhatikan kekuatannya dan mencoba untuk mempelajari lebih lanjut tentang dia, berjanji bahwa dia akan tetap di sisinya tidak peduli apa yang mungkin terjadi. Maka dimulailah perjalanan Souta saat dia bertemu teman dan kenalan baru sambil mengungkap misteri kemampuannya … yang mungkin berjalan lebih dalam dari yang diperkirakan siapa pun.