Setelah berjuang untuk membebaskan permainan sepak bola di Jepang dari Sektor Kelima, regu sepak bola negara itu dapat sekali lagi berharap untuk melangkah ke lapangan. Namun, tantangan baru akan muncul bagi pemain Jepang berupa Football Frontier International Vision 2, sebuah turnamen baru yang akan mempertemukan tim-tim terbaik yang bisa dikumpulkan setiap negara.

Tenma Matsukaze dan rekan satu timnya Raimon, Takuto Shindou dan Kyousuke Tsurugi, sekali lagi menjadi bagian dari aksi karena mereka telah dipilih untuk bermain untuk perwakilan Jepang, Inazuma Jepang. Sangat mengejutkan mereka, pelatih memilih delapan pemain lain yang tidak memiliki pengalaman bermain sepak bola sebelumnya!

Tim Inazuma Jepang akan memiliki gunung besar untuk didaki, membangun chemistry dan keterampilan saat mereka berjalan. Apa yang tidak mereka ketahui adalah bahwa turnamen akan menyiapkan panggung untuk sesuatu yang jauh lebih besar, sesuatu yang keluar dari dunia ini di Inazuma Eleven Go: Galaxy!