Mentransfer kesadaran manusia menjadi robot “I-Machine” sekarang menjadi kenyataan berkat penemuan bijih berharga yang disebut “orichalt.” Namun, ada kemungkinan kesadaran gagal untuk kembali ke tubuh inang, membuat mereka terjebak di dalam kerangka logam baru mereka untuk selamanya. Begitulah situasi anggota Excavate Company, sekelompok penambang I-Machine yang sembrono yang dipimpin oleh Grayman yang terkenal jahat yang bertujuan mengumpulkan orichalt untuk mendapatkan keuntungan.

Selama serangan penambangan, kelompok itu menyelamatkan Maya Mikuri, seorang siswa yang ditinggalkan oleh krunya. Dituduh mencuri informasi rahasia tentang orichalt oleh mantan rekannya, dia bergabung dengan Perusahaan Penggalian dengan harapan membersihkan namanya. Mereka kemudian memulai petualangan yang akan mengubah hidup mereka termasuk Ido, anggota ace kelompok tanpa ingatan masa lalunya. Untuk pertama kalinya, Ido mungkin memiliki kesempatan untuk menemukan kembali identitas aslinya.