Mereka yang menerima Wahyu Babel harus mengatasi banyak pertempuran dan pencobaan. Dengan menggenggam tangan partner spesial mereka, “Hand Shaker” ini membawa diri mereka ke alam Ziggurat, dimensi alternatif di mana waktu tidak ada lagi. Setiap pasangan Pengocok Tangan harus berjuang habis-habisan untuk mendapatkan hak untuk bertemu dengan Tuhan, yang akan menghadiahi mereka dengan mengabulkan satu permintaan.

Tazuna Takatsuki, seorang siswa SMA dengan kegemaran memperbaiki sesuatu, adalah salah satu dari Hand Shaker ini. Setelah menerima permintaan perbaikan dari Profesor Makihara dari universitas terdekat, Tazuna tersandung pada Koyori Akutagawa, seorang gadis terbaring di tempat tidur yang mengingatkannya pada saudara perempuannya yang telah meninggal, Musubu. Mengingat keinginannya yang sekarat untuk tidak pernah melepaskan tangannya, Tazuna menggenggam tangan Koyori dan membangkitkan kekuatannya sebagai Pengocok Tangan. Namun, kehidupan Koyori secara langsung terkait dengan statusnya sebagai Pengocok Tangan, yang berarti jika Tazuna melepaskan tangannya, dia akan mati. Dengan bertemu Tuhan sebagai satu-satunya harapan mereka untuk menyelamatkannya, keduanya harus menemukan cara untuk menyatukan kekuatan unik mereka, mengatasi Pengocok Tangan lawan, dan mewujudkan keinginan mereka.