Chiyo Sakura adalah gadis SMA ceria yang jatuh cinta pada Umetarou Nozaki yang tidak sadar. Banyak kebingungan Chiyo, ketika dia mengaku Nozaki tercinta, dia memberinya tanda tangan asing. Ternyata, remaja laki-laki yang tabah itu sebenarnya adalah seorang shoujo mangaka yang disegani, diterbitkan dengan nama pena Sakiko Yumeno! Serangkaian kesalahpahaman menyebabkan Chiyo menjadi salah satu asisten manga Nozaki.

Sepanjang peristiwa lucu yang terjadi kemudian, dia berteman dengan banyak teman sekolahnya yang unik, termasuk asistennya yang tampaknya tidak tahu malu, Mikoto Mikoshiba, dan “Pangeran Sekolah,” Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun mengikuti Chiyo saat dia berusaha membantu Nozaki dengan manganya dan berharap dia akhirnya akan menyadari perasaannya.