The Holy Grail War adalah pertempuran royale di antara tujuh orang majus yang melayani sebagai Master. Master, melalui penggunaan segel perintah yang diberikan saat mereka memasuki perang, memerintahkan Roh Pahlawan yang dikenal sebagai Servant untuk bertarung demi mereka dalam pertempuran. Dalam Perang Cawan Suci Kelima, Rin Toosaka adalah salah satu penyihir yang memasuki kompetisi. Dengan Hambanya, Pemanah, dia berharap untuk mendapatkan hadiah utama Cawan Suci, artefak magis yang mampu mengabulkan keinginan penggunanya.

Salah satu teman sekelas Rin, Emiya Shirou, secara tidak sengaja memasuki kompetisi dan akhirnya memerintahkan Servantnya sendiri yang dikenal sebagai Saber. Saat mereka menghadapi musuh bersama, Rin dan Shirou memutuskan untuk membentuk aliansi sementara saat mereka menantang lawan mereka dalam Perang Cawan Suci.