Legenda menceritakan bahwa ketika Bumi dihancurkan, pembuat jam besar Y membuat pengganti dari roda gigi dan roda gigi. Naoto Miura adalah seorang anak muda yang bercita-cita menjadi pembuat jam yang hebat. Namun, terlepas dari bakat uniknya yang peka terhadap pendengaran yang dapat segera memahami mekanika jarum jam dari kebisingan saja, dia hanya membuat sedikit kemajuan. Tapi ini berubah ketika peti mati jatuh dari langit ke apartemennya, mengungkapkan RyuZU, robot wanita yang ditempa oleh Y sendiri.

Berita tentang kedatangan RyuZU membawa Marie Bell Breguet, pewaris berbakat dari pembuat jam terkemuka, dan pengawal cyborgnya Vainney Halter ke dalam kehidupan Naoto juga. Ketika dia dan Naoto terlibat dalam pertempuran penuh aksi untuk hidup mereka, mereka menemukan kebenaran yang tidak menyenangkan: planet jarum jam yang telah ditinggali umat manusia selama lebih dari satu milenium mulai membongkar rahasia yang akan dibunuh banyak orang untuk dilindungi.