Tomoya Okazaki adalah anak nakal yang menganggap hidup membosankan dan percaya dia tidak akan berarti apa-apa. Bersama temannya Youhei Sunohara, dia bolos sekolah dan berencana membuang hari-hari sekolah menengahnya.

Suatu hari saat berjalan ke sekolah, Tomoya melewati seorang gadis muda yang bergumam pelan pada dirinya sendiri. Tanpa peringatan dia berteriak “Anpan!” (makanan Jepang yang populer) yang menarik perhatian Tomoya. Dia segera menemukan bahwa nama gadis itu adalah Nagisa Furukawa dan dia mengatakan hal-hal yang dia suka untuk memotivasi dirinya sendiri. Nagisa mengklaim mereka sekarang berteman, tetapi Tomoya pergi meninggalkan pertemuan itu sebagai bukan apa-apa.

Namun, Tomoya menyadari bahwa dia semakin memperhatikan Nagisa di sekitar sekolah. Akhirnya dia mengakui dan berteman dengannya. Tomoya mengetahui Nagisa telah ditahan setahun karena sakit parah dan mimpinya adalah untuk menghidupkan kembali klub drama sekolah. Mengklaim tidak ada yang lebih baik untuk dilakukan, dia memutuskan untuk membantunya mencapai tujuan ini bersama dengan bantuan empat gadis lainnya.

Karena Tomoya menghabiskan lebih banyak waktu dengan gadis-gadis itu, dia belajar lebih banyak tentang mereka dan masalah mereka. Saat dia mencoba untuk membantu setiap gadis mengatasi hambatannya masing-masing, dia mulai menyadari bahwa hidup tidak sesederhana yang dia pikirkan.