Saat musim panas tiba bagi para siswa di Akademi UA, masing-masing pahlawan super dalam pelatihan ini mengerahkan upaya terbaik mereka untuk menjadi pahlawan terkenal. Mereka menuju ke kamp pelatihan hutan yang dijalankan oleh pahlawan pro UA, di mana para siswa saling berhadapan dalam pertempuran dan menjalani tes berbahaya, meningkatkan kemampuan mereka dan melampaui batas mereka. Namun, perjalanan sekolah mereka tiba-tiba terbalik ketika League of Villains tiba, menyerang kamp dengan misi untuk menangkap salah satu siswa.

Boku no Hero Academia 3rd Season mengikuti Izuku “Deku” Midoriya, seorang siswa yang ambisius berlatih untuk mencapai mimpinya menjadi pahlawan yang mirip dengan panutannya All Might. Menjadi salah satu siswa yang terjebak di tengah kekacauan serangan penjahat, Deku harus mengambil sikap dengan teman-teman sekelasnya dan berjuang untuk kelangsungan hidup mereka.